Main Research Question
NADC34-like PRRSV의 중국 내 최신 동향을 정리하여, 유행 양상, 유전체적 특징, 재조합, 병원성, 그리고 백신 현황을 종합적으로 리뷰하고, 방역 전략 수립에 기초를 제공하고자 하였다.
Methods
- 2017–2021 기간에 GenBank에 등록된 중국 분리주의 PRRSV NADC34-like 전장유전체와 ORF5 서열 수집
- 관련 문헌을 대조해 각 분리주의 특징을 요약 정리
- 전장유전체와 ORF의 계통수를 작성하여 병행 해석
Key Findings
- 2017-2021 사이 중국에서 NADC34-like 검출이 증가했다. NADC34-like은 NSP2에서 연속 100 aa 결손을 특징으로 한다.
- ORF5 RFLP에서 2020–2021년에 1-4-4, 1-7-4, 1-6-4, 1-10-4의 상대적 빈도가 빠르게 증가하였다.
- NADC34-like와 타 아형 간 재조합 사례가 보고되며, 병원성이 다양하게 나타났다.
- 중국에서 사용하는 6종 상용 백신에 대해 평가한 결과, 생백신은 이종 보호에 제한적이며, 사백신은 야외주 방어 효과가 미약하다.
- NADC34-like의 유행을 지속 모니터링하여 고병원성 신규 변이 출현을 억제해야 한다.
Commentary
이전 리뷰에서는 PRRSV-2 L1C.5, RFLP-1-4-4 변이체 GX2024를 다뤘다. 이때 헷갈리는 지점은 RFLP와 계통 간의 관계인데, RFLP 1-4-4는 ORF5 제한효소 절단 패턴을 의미하는 표기일 뿐 계통 분류와는 독립적이다. 최근 문헌에서는 NADC30-like를 L1C(=1.8), NADC34-like를 L1A(=1.5)로 표기한다. NSP2 결손형으로 스크리닝하면 NADC30-like는 비연속 131 aa 결손, NADC34-like는 연속 100 aa 결손으로 나타난다. ORF5 계통학으로는 각각 L1C(=1.8)와 L1A(=1.5)로 나타난다. RFLP는 변이군 특정에 도움이 되는 지표로 활용하는 편이 좋다.
GX2024의 사례와 2017-2021 사이 중국에서 검출된 NADC34-like의 사례를 비교해 봤을 때, 동일한 RFLP 1-4-4 패턴을 공유함에도 불구하고 계통발생학적으로 서로 다른 분지를 가진다는 점을 알 수 있다. 이는 두 바이러스가 공통의 조상으로부터 유래했을 가능성은 있지만, 각 지역에 유입된 이후에는 서로 다른 야외주 및 백신주와 상호작용하며 독립적인 진화 경로를 밟아왔음을 시사한다.
Citation
Zhao H-z, Wang F-x, Han X-y, et al. Recent advances in the study of NADC34-like porcine reproductive and respiratory syndrome virus in China. Frontiers in Microbiology. 2022;13:950402. doi:10.3389/fmicb.2022.950402
https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2022.950402/full